Prírodou inšpirované algoritmy

študijné materiály pre projekt mobilnej triedy umelej inteligencie

Späť ku kurzom triedy
Obsah
Knižnice protilátok
Simulovanie všeobecnej imunitnej odozvy
Modelovanie HIV
Modelovanie efektu vakcinácie



Ostatné kapitoly
Freemanove K modely
Umelé imunitné systémy
Biomimicry - Biomimetics
Umelé chémie
Chemické vlny
DNK počítače
Artificial Music
Memetika
Artificial Life Games
Artificial Art
Väzenská dilema


Tutoriály
 Celulárne automaty
 Morfogenéza
 Simulátory
 Evolučné algoritmy
 Chaos
 Roboty
 Rôzne


Simulovanie všeobecnej imunitnej odozvy

Autory Celada a Seiden (Celada & Seiden, 1992) patria k prvým autorom, ktorí popísali model UIS využívajúci prístup "zdola--nahor" na simulovanie všeobecnej imunitnej odozvy. Model je postavený na princípe celulárnych automatov a sú v ňom implementované prvky imunity ako T-lymfocyty, B-bunky a APC-bunky. V modeli bol implementovaný algoritmus pozitívnej selekcie, viď nasledujúci obrázok.

ImmSim

Aplikácia ImmSim autorov Kleinstein a kolektív (Kleinstein et al., www) pomáha pochopiť a sledovať interakcie medzi jednotlivými entitami imunitného systému (B-bunky, T-lymfocyty, makrofágy, antigény, protilátky, APC-bunky, ... ). Na realizáciu simulátora bol použitý celulárny automat a model UIS autorov Celada a Seidena (Celada & Seiden, 1992).

Aplikácia ImmSim
Aplikácia ImmSim

Jednoduchý experiment (predchádzajuci obrázok) demonštruje imunitnú odozvu na antigén Ag. Na začiatku simulácie je antigén injektovaný do prostredia. Po dvadsiatich iteráciách nastáva prudký nárast počtu T-lymfocytov T spôsobený prítomnosťou antigénu a v tom istom čase začína množstvo antigénu prudko klesať. Po štyridsiatej iterácii sa antigén už v prostredí nenachádza. Pokiaľ by nasledovala ďalšia injektáž toho istého antigénu, odozva imunitného systému by bola rýchlejšia.

Hore
Kontakt: Marek Bundzel