Prírodou inšpirované algoritmy

Spojenia medzi vrstvami

Aj keď vrstvy v tomto modeli vykonávajú svoje funkcie nezávisle jedna od druhej (čo je vlastne to, čo dovoľuje ich opis na rozdielnych úrovniach), sú spojené jedna s druhou rozdielnymi spôsobmi.

• Vrstva vývojových informácií (developmental session) je zodpovedná za vytvorenie dvoch kalkulačných vrstiev. Determinuje, určuje tvar a formu buniek, kontrolujúcich typ a orientáciu individuálnych miest.
• Druhá kalkulačná vrstva berie vstupy zo starej DNA a taktiež z prvej kalkulačnej vrstvy. Spracováva informácie ktoré prijíma z týchto zdrojov a dáva ich ako výstupné semiačka informácií do vrstvy vývojových informácií a do novej DNA vrstvy.
• Prvá kalkulačná vrstva je hlavná vrstva v modeli, ktorá prijíma externé spojenia. Prijíma informácie o cieľových problémoch zvonku automatu, spracováva tieto informácie a potom odpovedá príslušným riešením. Ak je toto riešenie akceptovateľné, potom bunka získava "povolenie" pokračovať žiť. Táto vrstva pozná iba jeden spôsob komunikácie s ďalšími vrstvami automatu – môže prenášať informácie do druhej kalkulačnej vrstvy. Po zrelej úvahe neprijíma žiaden vstup zo zvyšku automatu, bola vytvorená iba so zámerom, aby zvyšok automatu neexistoval. Bolo to urobené kvôli tomu, aby práve takýmto spôsobom mohla orezať zvyšok automatu a používať ho nezávisle. Keby táto vrstva neustále prijímala vstupy zo zvyšku automatu, mohla by nastať situácia, že vyvinutou obchádzkou by sa "vyleptala" na tejto vrstve bunka, alebo populácia buniek, ktoré bývajú väčšinou vzdialené od celej reproduktívnej mašinérie zodpovednej za jej vytváranie a riešenie.