Prírodou inšpirované algoritmy

Zloženie vrstiev

Celulárne automaty na ktorých je HAL založený sú vytvorené z niekoľkých do značnej miery nezávislých vrstiev s rôznymi funkciami.

• Dve vrstvy podporujú univerzálny výpočet
• Tri sa používajú na prenos zdedených informácií z otca na potomka.

Kalkulačné vrstvy

Tieto vrstvy môžu byť zložené z akéhokoľvek štvorcového celulárneho automatu, ktorý je schopný univerzálnosti. V praxi sa hlavne zameriavame na dva druhy automatov:

• Upravený variant Margolusovej implementácie Fredkinovej biliardovej gule.
• 16-stavový, 1-bitový model, ktorý je používaný pri modelovaní boolovských sietí.

Kalkulačné vrstvy pozostávajú z týchto vrstiev:

• Prvá kalkulačná vrstva – vrstva na ktorej je konštruovaný dizajn výsledného cieľového spojenia.
• Druhá kalkulačná vrstva – používaná organizmami interne, keď sa spracúvajú informácie, ktoré sa následne dedia. Je tu špecifikovaná mapa genotypu a fenotypu a kde sa uskutočňuje rekombinácie, dedenie a pod.

Genetické vrstvy

Tieto vrstvy sa používajú na prenos zdedených informácií medzi generáciami buniek. Je tu vytvorený trojvrstvový model. Informácie medzi bunkami smerujú proti chodu hodinových ručičiek.

• „Stará“ DNA – surová kópia genetickej informácie od rodiča.
• „Nová“ DNA – je to genóm, ktorý sa stal potomkom. Nie nevyhnutne má korešpondovať so starým DNA organizmu. Otcove nové DNA sa stáva synovým starým DNA.
• Vrstva vývojových informácií (VVI) – tzv. development session, je to, čo v danej chvíli, aktuálne riadi potomka. Presne tak špecifikuje potomkov tvar a informácie na jeho dvoch kalkulačných vrstvách.

Sú tu aj ďalšie vrstvy obsahujúce znalosti ako status informácie pre každé miesto a unikátne ID zdieľané medzi všetkými miestami (pozíciami) v danej bunke. Tieto vrstvy sú nad danými fundamentálnymi (základnými) vrstvami a nie je potrebné pochopiť tieto vrstvy, ak chceme chápať dynamiku celého systému.